NCBI中blast后只有蛋白序列 如何得到基因序列?
2016-09-06技术资料
想要设计引物 可是NCBI中blast后只有蛋白序列 如何得到基因序列
我是想从一种真菌中P一个基因，但是找到了几个类似的，只能得到它的蛋白序列，却找不到基因序列 ，想问下虫友们，如何找到啊，或者是否能从蛋白序列去设计引物。
还有就是，在这一种病害的另一种致病菌中找相同的基因，就能找到基因序列，这是为什么啊？
DBSOURCE accession 点开了 可是打开后也还是没有基因序列，是一部分一部分的蛋白序列
在NCBI里的nucleotide 中搜索你要找的核酸序列，你可以根据基因名字查找，也可以根据ncbi序列号查找。用不着blast吧
楼上的是一种方法，肯定有的NCBI里，你可以请教一下实验室的人，还有就是你不能以氨基酸序列来设计引物，差距太大，不容易得到结果，实验顺利啊，加油
在NCBI里的nucleotide 中搜索你要找的核酸序列，你可以根据基因名字查找，也可以根据ncbi序列号查找。用不着blast吧
不好意思啊，是我说的不准确，NCBI里能找到那个基因，但是打开后，只有蛋白序列，没有像别的基因一样，能够出来基因的序列
楼上的是一种方法，肯定有的NCBI里，你可以请教一下实验室的人，还有就是你不能以氨基酸序列来设计引物，差距太大，不容易得到结果，实验顺利啊，加油
设计肯定得找到基因序列，可是能下到基因组序列，没有找到对应的那个基因的序列
听你的意思，你是想做同源克隆啊，那你就不用找什么基因序列了，估计目前没有发表的。同一个基因在不同物种里面一般会有高度保守的序列的，就像小鼠的Klotho基因和人的Klotho基因具有很高的同源性一样。
你可以找到这个蛋白的CDS序列（如果其CDS序列是标出来的），去Blast，然后取其高度保守的部分，设计兼并引物来进行PCR，这样就可以了。
你可以找到这个蛋白的CDS序列（如果其CDS序列是标出来的），去Blast，然后取其高度保守的部分，设计兼并引物来进行PCR，这样就可以了。
你可以把你要查的基因。还有你做的真菌名称发上来。我帮你搜搜
用CDS确实能找到啊，不过5个里面只找到了三个，其他的两个，没有基因序列显示，只有下面这些东西，求解释啊，非常感谢啊
CONTIG join(ABJE01000167.1:1..25706,gap(176),ABJE01000168.1:1..24274,
gap(7676),ABJE01000169.1:1..1663,gap(7637),ABJE01000170.1:1..33867,
gap(125),ABJE01000171.1:1..5120,gap(unk100),ABJE01000172.1:1..9906,
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曾经的我
你可以请教一下实验室的人，还有就是你不能以氨基酸序列来设计引物，差距太大，不容易得到结果，实验顺利啊，加油
已经找到了其中的三个基因序列，还有两个找不到的，谢谢鼓励，大家一起加油
我想问下在NCBI上找不到目的基因序列该怎么办呢
找到CDS 右键新打开一个窗口 试试